seq1 = cdna.seq, 485 bp
seq2 = genomic (49209AAGCTTGAAGATATAGTGTACTCAGGTAATGCATGAGATCATTAATCCAACCTTATTCGT), 110292 bp

>gi|2723128|gb|AA713211.1|AA713211 32771 Lambda-PRL2 Arabidopsis thaliana cDNA clone 246A4T7, mRNA sequence
>49209AAGCTTGAAGATATAGTGTACTCAGGTAATGCATGAGATCATTAATCCAACCTTATTCGT

(complement)

1-106  (28907-29012)   96% ->
107-275  (29350-29518)   98% <-
276-465  (29610-29801)   94%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 GAGAGTTATTACAACTTGAAAAACATGGCATCCAAGGCTTTGATTCTNTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
  28907 GAGAGTTATTACAACTTGAAAAACATGGCATCCAAGGCTTTGATTCTGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGTCTCTTCGCAATTNTNCTGGTGGTCTCCGAAGTTTCTNCCGCAAGAC
        |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||
  28957 GGGTCTCTTCGCAATTCTTCTGGTGGTCTCCGAAGTTTCTGCCGCAAGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTCGG         GCATGGTGAAGCCAGAGAGTGAGGCAACTNTGCAA
        ||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||| |||||
  29007 AGTCGGGTA...CAGGCATGGTGAAGCCAGAGAGTGAGGCAACTGTGCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTGAAGGTTATCACGGAGGACATGGTGGTCACGGAGGGGGAGGCCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29385 CCTGAAGGTTATCACGGAGGACATGGTGGTCACGGAGGGGGAGGCCACTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGGAGGAGGAGGCCACGGGCATGGAGGACACAACGGAGGAGGGGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29435 CGGAGGAGGAGGCCACGGGCATGGAGGACACAACGGAGGAGGGGGCCACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GACTTNACGGATACGGAGGAGGACATGGAGGACA         CTACGGG
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||<<<...<<<|-|||||
  29485 GACTTGACGGATACGGAGGAGGACATGGAGGACACTA...GGCC ACGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTTAACGGACCTNTTCAGACGAAACCGGGTGTTTAAAAGTTAAAACTATA
        ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29616 CTTAACGAACCTGTTCAGACGAAACCGGGTGTTTAAAAGTTAAAACTATA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 NAATAAATTCACCACCAGTCCACCATGCATAATTGCATCTCTATATACAC
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29666 AAATAAATTCACCACCAGTCCACCATGCATAATTGCATCTCTATATACAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTATGNCTTATAAGTATGCATCAAAATAAACCATGGTNAGTTT TAATGC
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||-||||||
  29716 TTATGTCTTATAAGTATGCATCAAAATAAACCATGGTGAGTTTGTAATGC

    450     .    :    .    :    .    :    .
    432 AGTTCCCTCAGAAATGTGTGG GTAATGTTTT TAA
        |||||| ||||||||||||||- |||||||||-|||
  29766 AGTTCCTTCAGAAATGTGTGGAATAATGTTTTATAA