seq1 = cdna.seq, 338 bp
seq2 = genomic (49259AAGCTTAATCATGCTAGGTGTATTTTATTGGATATGCCTGAAAAGGGTGTTCCTTGGGAT), 80676 bp

>gi|2708358|gb|T04011.1|T04011 214 AT-NHC Arabidopsis thaliana cDNA clone B70TP, mRNA sequence
>49259AAGCTTAATCATGCTAGGTGTATTTTATTGGATATGCCTGAAAAGGGTGTTCCTTGGGAT

1-53  (18943-18995)   96% ->
54-338  (19212-19496)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 TAGGTCTCGCACCAAAGAAGANCGGAGAAGATANCGCGAAAGAAACCGCA
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
  18943 TAGGTCTCGCACCAAAGAAGATCGGAGAAGATATCGCGAAAGAAACCGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAG         GAATTGAGTGGAACAGTGAGGGAGATTCTGGGAACTTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  18993 AAGGAA...AAGGAATTGAGTGGAACAGTGAGGGAGATTCTGGGAACTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTGTCTGTTGGTTGTACTGTGGATGGGAAAGATCCTAAAGATATTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  19250 TGTGTCTGTTGGTTGTACTGTGGATGGGAAAGATCCTAAAGATATTCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGAGATTCAAGATGGTGAAGTTGAGATTCCTGAGAACTGAAGAATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  19300 AGGAGATTCAAGATGGTGAAGTTGAGATTCCTGAGAACTGAAGAATTTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAATGATGGTGTGTTTGTTTCCTTTGCCTTTTGAGATTTTAGTTTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  19350 AAATGATGGTGTGTTTGTTTCCTTTGCCTTTTGAGATTTTAGTTTCTTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTTATGTTTTGTTTAGAACAACGACAAGTCAGTTTTGGATTGTTATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  19400 TCTTATGTTTTGTTTAGAACAACGACAAGTCAGTTTTGGATTGTTATTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    292 TGCTTTTTTATCTAATCTCAATTTTATGCTTATGCTTAGTTTCTTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  19450 TGCTTTTTTATCTAATCTCAATTTTATGCTTATGCTTAGTTTCTTTC